Центральные склады Энкора - это отапливаемые сухие помещения общей площадью более 20 000 квадратных метров. Все ворота оборудованы герметизаторами проёмов, чтобы исключить намокание товаров, и уравнительными платформами, чтобы исключить толчки и опрокидывание поддонов при погрузочно-разгрузочных работах.
Кроме того, в Москве, Санкт-Петербурге и Ростове-на-Дону расположены региональные склады.